
在細菌全基因組測序(WGS)實驗中,磁珠DNA純化是文庫制備的核心環(huán)節(jié)。傳統(tǒng)手工操作不僅耗時費力、易引入人為誤差,還會限制樣本通量與實驗穩(wěn)定性。如今,Hamilton Microlab PuriFY自動化純化平臺帶來全新解決方案,適配NGS文庫制備流程,大幅提升實驗效率與測序質量!

一、痛點直擊:手工純化的諸多難題
下一代測序文庫制備包含多步磁珠純化流程,人工操作短板十分突出:
操作步驟繁瑣,全程占用大量人力;
多批次樣本處理時,人為失誤概率飆升;
磁珠殘留、操作不均等問題,間接影響下游測序結果;
吸頭等耗材消耗量大,實驗成本居高不下。
為破解以上問題,本次聯(lián)合National Jewish Health開展對比實驗,驗證 Microlab PuriFY自動化純化系統(tǒng)的應用價值。
二、實驗方案:自動化VS手工,同臺對比

實驗選取7株細菌分離株,采用QIAgen試劑盒提取基因組DNA,搭配Quantabio sparQ系列試劑盒構建測序文庫,分別設置手工純化組與Microlab PuriFY自動化純化組,每組設置重復樣本與無模板對照(NTC)。
兩組嚴格按照對應流程完成兩輪磁珠純化,從操作時長、耗材用量、核酸濃度純度、文庫片段、測序數(shù)據(jù)五大維度開展綜合評估。
依托MagPore技術(雙磁鐵系統(tǒng)+正壓驅動+專用純化條),自動化系統(tǒng)可高效完成上清轉移、多次洗滌、核酸重懸與洗脫收集,大幅簡化流程。
三、硬核實測:多項數(shù)據(jù)優(yōu)秀
三、硬核實測:多項數(shù)據(jù)優(yōu)秀
1. 人力&耗材大減負,降本增效看得見
兩輪純化累計耗時對比:
手工操作:總計50分鐘
Microlab PuriFY:總計16分鐘
人工操作時長縮減3.1倍,科研人員從重復機械操作中解放。
耗材消耗對比:
手工操作:總計使用79支吸頭
Microlab PuriFY:總計使用18支吸頭
吸頭用量減少4.4倍,有效降低實驗耗材成本。
2. 文庫質量穩(wěn)定,片段完整性優(yōu)異
通過Qubit、NanoDrop、Agilent TapeStation多重質控檢測:
核酸純度:兩組260/280、260/230吸光比值均處于合格區(qū)間,純度表現(xiàn)相當;

文庫濃度:自動化組濃度均一性更強,數(shù)據(jù)波動更小;

片段長度:手工組平均357.4bp,自動化組平均393.7bp,文庫完整性更佳,片段分布符合測序要求。

同時實驗發(fā)現(xiàn),手工流程易出現(xiàn)磁珠殘留,而Microlab PuriFY全程無磁珠攜帶污染,規(guī)避了雜質對后續(xù)實驗的干擾。平臺還具備自動排障能力,遇到管路堵塞可自動加壓疏通,實驗容錯率更高。
3. 測序表現(xiàn)跨越式提升,測序深度達標無憂
采用Illumina MiSeq開展上機測序,核心數(shù)據(jù)差距顯著:
測序數(shù)據(jù)產量:自動化組數(shù)據(jù)產出約為手工組的3倍,讀段數(shù)量大幅提升;
基因組覆蓋深度:手工樣本中位覆蓋深度僅25~33×,自動化樣本可達 65~73×,輕松突破傳統(tǒng)方法瓶頸,穩(wěn)定實現(xiàn)>40×的理想測序深度;
測序質量:兩組Q30優(yōu)質讀占比基本持平,測序堿基可靠性均有保障。
充足的數(shù)據(jù)產出與更高的覆蓋深度,讓細菌基因組分析結果更精準、更全面。
四、平臺核心優(yōu)勢,適配臨床&科研實驗室
操作簡單易上手:程序編寫、修改、運行門檻低,快速落地現(xiàn)有實驗體系;
設備布局靈活:機身占地面積小,搭配定制化觸控屏幕,適配各類實驗室空間;
流程高度兼容:匹配主流NGS文庫制備試劑盒,通用度廣;
專業(yè)技術支持:原廠配套服務,保障實驗穩(wěn)定運行。
五、總結
從人力成本、耗材消耗,到文庫質控、上機測序,Hamilton Microlab PuriFY自動化DNA純化系統(tǒng)全面優(yōu)于傳統(tǒng)手工操作。它不僅解決了細菌全基因組測序文庫純化的人工痛點,更顯著提升測序數(shù)據(jù)質量與實驗重復性,是高通量NGS實驗室提質增效的理想選擇。
無論是基礎科研、病原微生物檢測,還是規(guī)模化樣本測序項目,這款自動化平臺都能為您的實驗保駕護航!
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